Trường hợp phát hiện dấu hiệu vi phạm pháp luật thuế, cơ quan thuế phải lập danh sách và phối hợp với các ban, ngành, địa phương thực hiện việc kiểm tra tại địa bàn để xử lý theo pháp luật thuế và các pháp luật chuyên ngành, hoặc chuyển hồ sơ cho cơ quan công an nếu xác định đây là hành vi trốn thuế.

Tổng cục Thuế chỉ đạo cơ quan thuế giám sát chặt, đảm bảo 100% giao dịch, trong đó có đơn hàng thương mại điện tử, phải được xuất hóa đơn điện tử.