Đề án được chia làm ba giai đoạn, trong đó giai đoạn 2 (2027-2030) và giai đoạn ba (2030-2045) sẽ tiến hành thu phí phương tiện vào nội đô. Để phục vụ việc thu phí nội đô, Đề án đề xuất phương án thanh toán điện tử, thay thế phương thức thanh toán bằng vé trong tham gia giao thông, giúp lưu thông nhanh chóng, thuận tiện. Việc thanh toán điện tử sẽ thực hiện khi ô tô qua các trạm thu phí nội đô dưới hình thức thẻ vé liên thông trong tham gia giao thông.
Thời gian thực hiện dự kiến sẽ bắt đầu từ năm 2024 đến năm 2026. Đối tượng phục vụ của phương thức thanh toán này sẽ là người tham gia giao thông, doanh nghiệp, cơ quan quản lý.