Nhiều nguyên nhân dẫn đến vi phạm chủ yếu là do đất đã được nhà nước giao, cho thuê để thực hiện dự án đầu tư nhưng không được sử dụng trong thời hạn 12 tháng liên tục hoặc chậm tiến độ sử dụng đất quá 24 tháng kể từ khi nhận bàn giao đất.
Một số trường hợp do chưa giải phóng mặt bằng hoặc tự ý chuyển quyền sử dụng đất khi chưa được cấp phép, chuyển nhượng không đúng quy định tại Luật Đất đai. Phần lớn các trường hợp vi phạm đều được kiến nghị xử lý gia hạn sử dụng 24 tháng và phải nộp cho nhà nước khoản tiền tương ứng với mức tiền sử dụng đất, tiền thuê đất đối với thời gian chậm tiến độ thực hiện dự án trong thời gian này. Một số trường hợp đề nghị xử lý bãi bỏ Quyết định giao đất hoặc thu hồi đất, có thể thấy Hà Nội đang rất quyết tâm trong công tác rà soát xử lý các dự án chậm tiến độ trên địa bàn.
