Được biết phương pháp thặng dư lấy tổng doanh thu ước tính trừ đi tổng chi phí phát triển ước tính của thửa đất trên cơ sở sử dụng đất có hiệu quả cao nhất. Tuy nhiên dự thảo sửa đổi, bổ sung Nghị định 44 chưa tính chi phí dự phòng và lãi vay trong tổng chi phí phát triển ước tính của thửa đất. Trong khi đó, quá trình thực hiện dự án thường phát sinh thêm chi phí đầu tư xây dựng nên việc lập chi phí dự phòng rất cần thiết.
Hơn nữa, khi doanh nghiệp thực hiện nhiều dự án sẽ phải phân bổ vốn chủ sở hữu đảm bảo tỷ lệ cho từng dự án. Do đó, các chủ đầu tư phải huy động thêm nguồn vốn khác, trong đó có vốn vay tín dụng. Do vậy cần xem xét bổ sung hai khoản vào cách tính chi phí phát triển thửa đất gồm: chi phí dự phòng theo quy định về xây dựng và chi phí lãi vay theo quy định về thuế.
