Tổ công tác do Phó thủ tướng Trần Hồng Hà làm tổ trưởng, các tổ phó gồm Bộ trưởng các bộ Giao thông Vận tải, Xây dựng, Chủ tịch UBND Thành phố Hà Nội, Chủ tịch UBND Thành phố Hồ Chí Minh và 9 ủy viên.
Tổ công tác sẽ giúp Ban Chỉ đạo Nhà nước các công trình quan trọng quốc gia, trọng điểm ngành giao thông vận tải (Thủ tướng Phạm Minh Chính là trưởng ban) điều phối, đôn đốc các bộ, ngành, đơn vị xử lý vướng mắc để các dự án đường sắt đô thị ở hai thành phố lớn đảm bảo tiến độ. Hàng tháng, tổ sẽ đánh giá kết quả thực hiện, xử lý tồn tại hoặc báo cáo Thủ tướng.
Quá trình hoạt động, tổ nghiên cứu, đề xuất các giải pháp để tháo gỡ khó khăn trong chính sách đầu tư. Nếu cần thiết, tổ được nghiên cứu học tập kinh nghiệm một số nước có đường sắt đô thị hiện đại và mời các chuyên gia quốc tế có kinh nghiệm góp ý.
UBND Thành phố Hà Nội và Thành phố Hồ Chí Minh có trách nhiệm báo cáo tình hình thực hiện các dự án cho tổ công tác, định kỳ một tháng hoặc đột xuất theo yêu cầu.
Kinh phí hoạt động của tổ do ngân sách nhà nước đảm bảo và được bố trí thường xuyên. Tổ sẽ giải thể sau khi dự án hoàn thành và đưa vào khai thác, sử dụng hoặc theo chỉ đạo của Thủ tướng.
