Theo đánh giá của các chuyên gia, việc di dời nhà trên và ven kênh rạch càng chậm theo thời gian. Cụ thể, giai đoạn 1993 - 2020 mới di dời được 38.185 hộ. Nguyên nhân khiến chương trình này càng ngày càng chậm bởi trước đây được dùng bằng vốn ngân sách, sau đó sử dụng hình thức hợp tác công tư (PPP). Hiện nay, luật không cho phép dùng hình thức này, trong khi vốn ngân sách hạn chế khiến chương trình bị đình trệ. Thực tế, đa số nhà trên và ven kênh rạch đều lấn chiếm, không đủ điều kiện để bồi thường, mà chỉ được nhận một phần hỗ trợ của thành phố, không đủ để người dân tạo lập nơi ở mới, nên người dân không đủ điều kiện di dời.
