Theo Quyết định số 609/QĐ-TTg, Ủy viên Bộ Chính trị, Thủ tướng Chính phủ Phạm Minh Chính làm Trưởng Ban Chỉ đạo; Ủy viên Trung ương Đảng, Phó Thủ tướng Chính phủ Trần Hồng Hà làm Phó Trưởng Ban Thường trực.
Ban Chỉ đạo sẽ giúp Chính phủ, Thủ tướng Chính phủ chỉ đạo triển khai thực hiện công trình trọng điểm, dự án quan trọng quốc gia lĩnh vực đường sắt như: dự án đường sắt tốc độ cao trên trục Bắc - Nam; các tuyến đường sắt Lào Cai - Hà Nội - Hải Phòng, Hà Nội - Lạng Sơn, Móng Cái - Hạ Long (Quảng Ninh) và các dự án đường sắt đô thị tại thành phố Hà Nội và Thành phố Hồ Chí Minh. Kinh phí hoạt động do ngân sách Nhà nước bảo đảm.
