Truyền thông Indonesia cho biết, thành phố Nusantara được xây dựng trên vùng đất giàu than bùn, nên nước ngầm ở Nusantara có xu hướng chứa sắt và sunfua. Sự kết hợp của hai chất này khiến cho nước không thể sử dụng cho sinh hoạt của người dân. Đáng lo ngại hơn, nguy cơ lũ lụt đang gia tăng ở khu vực này, đặc biệt là với các công trình xây dựng rất lớn đang diễn ra.

Trước lo ngại này, chính phủ Indonesia đã hoàn thành việc xây dựng đập Sepaku Semoi, một trong 4 đập được quy hoạch để đáp ứng nhu cầu nước của người dân Nusantara trong tương lai. Tuy nhiên, các chuyên gia cho rằng, cách tốt nhất để đáp ứng nhu cầu về nước sạch, đồng thời giảm nguy cơ lũ lụt ở khu vực Nusantara là tổ chức lại lưu vực Riko Manggar, khôi phục chức năng của rừng như một phương tiện bảo tồn đất và nước.