Tập đoàn gồm các công ty con, công ty thành viên trong và ngoài nước, được chia thành nhiều tầng lớp (gọi tắt là hệ sinh thái Vạn Thịnh Phát), trong đó Tập đoàn Vạn Thịnh Phát giữ vai trò trung tâm, nắm giữ cổ phần, kiểm soát toàn bộ hoạt động của các công ty trong hệ sinh thái và thường không tham gia trực tiếp vào hoạt động kinh doanh. Các công ty “ma” này được lập ra để đứng tên các khoản vay khống, chuyển nhương cổ phần, lấy pháp nhân góp vốn đầu tư vào các dự án.
Theo kết quả điều tra, bà Trương Mỹ Lan và các đồng phạm đã gây thiệt hại cho Ngân hàng SCB gần 200 nghìn tỷ đồng.